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O programa de pós-graduação em Alergia, Imunologia e Pneumologia tem como objetivo a formação de pediatras especializados nas referidas áreas, estando credenciado no MEC (# 126-01 de 08 de novembro de 2001). Este programa pretende habilitar o pós graduando ao exercício competente das referidas sub-especialidades, preenchendo os requisitos mínimos recomendados pela Sociedade Brasileira de Pneumologia e Tisiologia, Associação Brasileira de Alergia e Imunopatologia (ASBAI) e pela Fundação do Desenvolvimento Administrativo (FUNDEP), além de acatar sugestões elaboradas pelos Comitês de Alergia e Pneumologia da Sociedade Brasileira de Pediatria.

Este terá acesso à enfermaria excluisva com casos de pneumologia pediátrica, laboratório completo de pneumologia e alergia, polissonografia, serviço de broncoscopia e endoscopia digestiva. Além disto, o pós graduando terá acesso a diferentes ambulatórios incluindo pneumologia, alergia, asma de difícil controle, displasia broncopulmonar, hipertensão pulmonar, Tuberculose, alergia alimentar, neuropatas com pneumopatias de repetição, respirador bucal, doenças do sono, doenças neuromusculares e ambulatóorio de pacientes traqueostomizados

Haverá também estágios rotatórios em ambulatórios de Imunodeficiência primária, Reumatologia pediátrica e Fibrose Cística, bem como atendimento domiciliar de crianças com distrofia neuromuscular (Programa Ventilar). O pós graduando participará também de atividades teóricas visando a desenvolver sua capacidade de transmitir conhecimentos, realizar, interpretar e publicar trabalhos científicos.

O programa têm a duração de dois anos, exigindo-se como pré requisito a conclusão de dois anos de residência de pediatria geral. Ao final da sua especialização, o pós graduando deverá apresentar uma monografia ou finalizar um trabalho científico, como modo de avaliação.

Ao término do treinamento o pós graduando estará elegível para as provas de título de Alergia, Alergia Pediátrica e Pneumologia Pediárica